[Rosetta@Home] Topic ufficiale

[NoxDaFox]

Inoltre adesso il server dove usavano gli algoritmi che noi abbiamo collaborato a migliorare per scopi pratici, adesso si appoggia pure lui a BOINC (prima riuscivano a macinar ciò internamente, ora evidentemente no, meglio, vuol dir che evidentemente più gente usa gli algoritmi di Rosetta)

non riesco a comprendere il significato di questa frase

intendi forse dire: "se prima si appoggiavano su BOINC solo per testare l'efficacia dei loro algoritmi, ora utilizzano la piattaforma anche per i calcoli veri e propri."?

[Gabi.2437]

Esattamente.

Prima rosetta usava BOINC per migliorare gli algoritmi e poi per i calcoli veri e propri metteva a disposizione degli scienziati un server chiamato Robetta dove appunto applicavano gli algoritmi fatti grazie a BOINC.

Adesso anche parte del lavoro di Robetta verrà svolto tramite BOINC.

[showa]

Buon segno, no?

[Gabi.2437]

Direi proprio di si!

[Balzy]

mi sono iscritto anche io!

[showa]

[NoxDaFox]

ciao Balzy, benvenuto!

posso chiederti con che macchina elabori?

[Gabi.2437]

After about 2 years of work, millions of CPU hours donated by volunteers from around the globe on Rosetta@HOME and a fruitful collaboration with Daniel Keedy and Jane and David Richardson at Duke University our paper on energy landscapes is finally out! Thank you to everyone who helped and especially to Daniel Keedy @ Duke and all who have donated computing time!


http://www.miketyka.com/2010/12/energy_landscapes/

e qua articolo completo

http://www.miketyka.com/data/mtyka_dkeedy_2010.pdf

[showa]

Quanto spazio su hdd vi tiene Rosetta??? Ho appena scoperto sul mio quasi un giga!!!!!

[NoxDaFox]

320 Mb, ma ho un dual-core

[showa]

Vabbeh, ma poi sono un deficiente: se imposto una cache di 3 giorni, ci credo che il n° di wu scaricate porta ad occupare così tanto spazio

[NoxDaFox]

nuova pubblicazione:

Today's issue of Nature Structural Biology reports the determination of the structure of a protein by FoldIt players. This is exciting because it is perhaps the first example of a long standing scientific problem solved by non-scientists. You might read about this in your newspaper; here is a report that does a good job in explaining how FoldIt came out of Rosetta@home:
http://the-scientist.com/2011/09/18/...ein-structure/

Stanno dandoci dentro i ragazzi di rosetta!
Il numero di WUs pronte e impressionante!

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

[showa]

*ene.

[NoxDaFox]

David Backer inventore dell'anno secondo UW Medicine

[showa]

Ottimo. Sperando la "pubblicità" porti sempre più persone a contribuire a progetti (medici, mia personale speranza) di calcolo distribuito.

[NoxDaFox]

Ho raggiunto quota 2000000!!

Dopo piu` di 5 anni di cammino gran parte passati nel TGM Team! Un grande risultato di cui vado fiero!


E ora vediamo di fare i 2,5!

[Hellcobra]

grande!!

[showa]

I have exciting news. We and the University of Washington are starting up a new Institute for Protein Design to design new proteins to address current challenges in medicine, energy, and other areas. You can learn more about the institute at http://depts.washington.edu/ipd/. Rosetta@home is and will continue to be a critical part of our efforts. For every new potential protein therapeutic we design, we use Rosetta@home to test whether it will actually fold into the desired structure. And we need help! We have quite a backlog of exciting new designed proteins to test on Rosetta@home because we are designing proteins for quite a range of problems-new anti flu proteins, anti-cancer proteins, and new materials--and it takes 3000-5000 work units to test each one. This Rosetta@home testing is becoming the slow step in the whole design process, often taking over 10 days to complete. So please tell your friends and relations to join us!

A generous donor has provide funds which we want to use to invite 5-10 Rosetta@home participants to visit the Institute and see what we are trying to accomplish first hand. More on this in my next post.


Scritto da David Baker, of course. Esticazzi!!! Complimentissimi.