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  1. #1
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    World Community Grid



    Da questa pagina, ovviamente, si può accedere a tutte le parti del sito. Sezione relativa alle ricerche attualmente portate avanti: http://www.worldcommunitygrid.org/pr...iewResearch.do

    Ambito: Ricerca medica

    Premessa/Introduzione:
    World Community Grid non è un progetto come gli altri, ma presenta alcune differenze. Innanzitutto per lungo tempo ha sfruttato un suo client, chiamato UD (United Devices), e solo recentemente ha supportato BOINC. Il primo che ho citato, sebbene ancora funzionante, si consiglia di non utilizzarlo, perché verrà presto completamente abbandonato.
    Altra particolarità è questa: il WCG al suo "interno" porta avanti diversi progetti. Attualmente sono:

    - Help Conquer Cancer (lanciato il 6 novembre 2007)
    L'Ontario Cancer Institute (OCI), il Princess Margaret Hospital e la University Health Network si sono uniti a World Community Grid per migliorare i risultati della cristallografia a raggi X delle proteine col fine di ampliare le conoscenze sul cancro e sui suoi trattamenti. Link

    - Help Fight Childhood Cancer (lanciato il 17 marzo 2009)
    L'Università di Chiba, in Giappone, ha lanciato questo progetto che mira a trovare farmaci atti a bloccare 3 proteine che sono la causa del neuroblastoma (un tipo di cancro che colpisce principalmente i bambini). Identificare queste medicine potrebbe rendere il tumore più facilmente curabile dalla chemioterapia. Link

    - AfricanClimate@Home (lanciato il 3 settembre 2007)
    Il World Community Grid e ricercatori del Climate Systems Analysis Group dell'Università di Città del Capo si sono uniti per sviluppare modelli climatici più accurati degli attuali per specifiche regioni africane. Questo servirà come base per capire come il clima cambierà nel futuro. Link

    - Discovering Dengue Drugs - Together (lanciato il 21 agosto 2007)
    Scienziati del dipartimento medico dell'Università del Texas e dell'Università di Chicago combattono coi ricercatori del WCG contro alcune delle malattie più diffuse nei paesi sottoviluppati (e non). Il fine immediato del progetto è scoprire nuovi farmaci per curare la febbre emoraggica dengue, l'epatite C, l'encefalite West Nile e la febbre gialla; tutte queste malattie derivano dall'infezione di virus della famiglia Flaviviridae. Link

    - Help Cure Muscular Dystrophy (lanciato il 19 dicembre 2006)
    Il World Community Grid e i ricercatori supportati da Decrypthon, un'alleanza fra AFM (Associazione Francese Distrofia Muscolare), CNRS (Centro Nazionale Francese per le Ricerche Scientifiche) e IBM stanno indagando sulle interazioni proteine-proteine per 40.000 proteine di cui è nota la struttura, con particolare attenzione su quelle proteine che giocano un ruolo nelle malattie neuromuscolari. Il database che si sta formando aiuterà i ricercatori a produrre molecole per inibire o incrementare i legami di particolari macromolecole, il che si spera porterà a migliori trattamenti per la distrofia muscolare e altre malattie neuromuscolari. Link

    - Human Proteome Folding - Phase 2 (lanciato il 23 giugno 2006)
    Il progetto continua da dove è terminata la Fase 1. I due obiettivi principali sono: 1) ottenere strutture a risoluzioni più alte di specifiche proteine umane e 2) esplorare ulteriormente i limiti della previsione della struttura delle proteine attraverso l'ulteriore sviluppo del software Rosetta. Link

    - FightAIDS@Home (lanciato il 21 novembre 2005)
    Come dice il nome, è un progetto che mira a trovare possibili farmaci che abbiano le giuste caratteristiche chimiche per bloccare la proteasi dell'HIV. Questo approccio è chiamato "Structure-Based Drug Design", e secondo il National Institute of General Medical Sciences, ha già avuto un grande impatto sulle vite delle persone che soffrono di AIDS. Link

    Il fatto che WCG porti avanti più di una ricerca influenza anche il modo attraverso il quale partecipare con BOINC. La descrizione di come aderire ad uno o più progetti è spiegata immediatamente sotto.

    Per aderire al progetto tramite BOINC:
    Prima di tutto occorre registrarsi nel sito del WCG, all'indirizzo http://www.worldcommunitygrid.org/reg/viewRegister.do Durante questa fase viene chiesto a quali progetti aderire. Ed è in base alle scelte che si operano che BOINC scaricherà le WU di quel o di quei progetti.
    Una volta registrati, la procedura sotto BOINC è uguale a Rosetta, per fare un esempio: il WCG compare nell'elenco, e vi chiederà i dati che avete appena immesso nella pagina del sito.

    TGM Team:
    Fondato da Kaaio. Come tutti gli altri, si chiama TGM Team. Il link è http://www.worldcommunitygrid.org/te...mId=SK25HC49Q1

    Statistiche del TGM Team:
    http://it.boincstats.com/stats/team_...r=wcg&id=10226

    Stato del progetto e delle iscrizioni:
    Il progetto è attivo. Le iscrizioni sono aperte.

    Presenza di un forum:
    Sì. L'url è http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/index

    Disponibilità delle WU:
    Eccellente.

    Caratteristiche delle WU:
    Il tempo di elaborazione delle WU dipende dalla potenza del pc. Si va dalle 3 alle 10 ore.
    Presenza dei checkpoint: sì
    La distribuzione delle WU del o dei progetti a cui si è aderito viene fatta in automatico dal sistema.
    Il tempo di completamento (medio) è di 10 giorni.

    Per Human Proteome Folding - Phase 2:
    Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 15
    Initial replication (numero di WU inviate): 19

    Per Fight AIDS@Home:
    Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 1
    Initial replication (numero di WU inviate): 1
    RAM impegnata per ogni WU: circa da 90 a 110 megabyte

    Per Help Conquer Cancer:
    Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 2
    Initial replication (numero di WU inviate): 2
    RAM impegnata per ogni WU: circa da 45 a 50 megabyte

    Per Help Fight Childhood Cancer:
    Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 1
    Initial replication (numero di WU inviate): 1
    RAM impegnata per ogni WU: circa da 70 a 80 megabyte

    Requisiti minimi a livello hardware/software usando BOINC:
    Dato che al suo "interno" il World Comunity Grid porta avanti ricerche su diversi temi, i requisiti differiscono da un progetto all'altro. L'elemento in comune è il sistema operativo: Windows 98, ME, 2000 o XP.

    AfricanClimate@Home:
    - almeno 512 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
    - 1 GB di spazio libero sul disco fisso
    - possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
    - connessione internet con velocità minima 512 kbps

    Discovering Dengue Drugs:
    - almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
    - 50 MB di spazio libero sul disco fisso
    - possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
    - connessione internet con velocità minima 40 kbps

    FightAIDS@Home:
    idem come sopra

    Human Proteome Folding - Phase 2:
    - almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
    - 100 MB di spazio libero sul disco fisso
    - possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
    - connessione internet con velocità minima 40 kbps


    Requisiti minimi a livello hardware/software usando il client UD:
    FightAIDS@Home:
    - processore Intel Pentium a 550MHz o equivalente
    - almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
    - 50 MB di spazio libero sul disco fisso
    - possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
    - connessione internet con velocità minima 40 kbps
    - Windows 98, ME, 2000 o XP

    Human Proteome Folding - Phase 2 project:
    Idem come sopra, con la differenza che lo spazio minimo su disco aumenta a 100 MB

    Screensaver:
    Presente.
    Ultima modifica di showa; 03-04-09 alle 09:17:58

  2. #2
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Domanda un po' strana, a solo scopo curiosità: se per un qualsiasi motivo su un pc volessi elaborare solo WU di un progetto di WCG, e su un altro pc le WU di un altro, dovrei creare due account, giusto?

  3. #3
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    No. Su WCG, parimenti alla possibilità di personalizzare i profili Home, School, Work negli altri progetti BOINC, è possibile creare dei profili personalizzati, da accostare poi ai vari host connessi. In un profilo puoi impostare le varie opzioni presenti nelle preferenze di boinc manager, e anche i progetti a cui partecipare.

  4. #4
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Bello però non so se parteciperò, dato che già ora la lista dei progetti a cui partecipo è molto (per me) lunga... boh.

  5. #5
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Ho "contagiato" un altro pc in ufficio, e ho colto l'occasione di aderire anche al WCG. Ma non apporterò chissà quale contributo, dato che il tempo di completamente è superiore alle 7 ore

  6. #6
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    ogni contributo è sempre importante..

  7. #7
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    News da World Community Grid:

    Help Conquer Cancer (Launched November 6, 2007)
    The Ontario Cancer Institute (OCI), Princess Margaret Hospital and University Health Network have teamed with World Community Grid to improve the results of protein X-ray crystallography in order to increase understanding of cancer and its treatment.
    Un nuovo progetto si aggiunge a quelli già presente nel WCG, dedicato totalmente alla ricerca contro il cancro.
    Invito tutti ad andare nel proprio profilo sul sito di WCG ed aggiungere questo nuovo progetto tra quelli da elaborare!

    Se non sapete come si fa ecco come procedere:
    - andare sul sito del WCG e loggarsi.
    - andare in MyProjects
    - spuntare il progetto Help Conquer Cancer
    - premere il pulsante save

    mi raccomando, diamo il nostro contributo a questo importante progetto!

    due link di riferimento:
    http://www.worldcommunitygrid.org/pr...iewHcc1Main.do
    http://www.cs.toronto.edu/~juris/

  8. #8
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Ma porc... proprio quando sta per iniziare la distribuzione delle WU di SIMAP...

  9. #9
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    beh c'è scritto 6 novembre..magari al momento non lasciano WUs..

  10. #10
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Definire LENTO il sito di WCG è un eufemismo.
    Dov'è che parla del 6 novembre?

  11. #11
    Gabi.2437
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Ma sto Help Conquer Cancer, è la fase 2 di Help Defeat Cancer vero?

  12. #12
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Boh. Non ho trovato riferimenti in tal senso.

  13. #13
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Citazione Originariamente Scritto da showa Visualizza Messaggio
    Definire LENTO il sito di WCG è un eufemismo.
    Dov'è che parla del 6 novembre?
    già..l'ho notato anche io..

    http://www.worldcommunitygrid.org/pr...iewResearch.do

    Citazione Originariamente Scritto da Gabi.2437 Visualizza Messaggio
    Ma sto Help Conquer Cancer, è la fase 2 di Help Defeat Cancer vero?
    mah non credo..i due progetti sono portati avanti da istituiti diversi, e studiano cose diverse.

  14. #14
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    O sto invecchiando precocemente, oppure sono già rimba... l'avevo scritto anch'io nel topic iniziale che c'era quel progetto... oddio, devo mangiare più pesce!!!

  15. #15
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    no invece sei proprio rimba..
    l'ho editato io prima il topic iniziale..

  16. #16
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    'stardo!!! Mi da solo
    La WU che sto elaborando è pesantuccia (sul mio pc, ovviamente): 13 ore e 20, circa. 40 megabyte di RAM occupata.

  17. #17
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    io non so ancora..ho visto stasera che ne sta elaborando una la mia morosa, ma io al momento sono al 100% su QMC..

  18. #18
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Alla fine ci ha impiegato poco più di 6 ore.

  19. #19
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    e la schermata grafica com'è?

  20. #20
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Oddio, non è che sia chissà cosa. Ci sono dei dischi colorati che appaiono nel centro della videata. Insomma, una cosa del genere:

    Direttamente dalle FAQ del progetto:
    What are the round disks? Each disk has a different color. What does that mean?
    Each disk is a visualization of a different texture measure applied to the background image. Thus, when two disks are differently colored, it means only that different textures are more or less prominent in different regions of the image. Twenty-six measures of texture are visualized in the Grid agent.

    Each measure is related to frequencies of the grey-scale values of pairs of pixels found in the image, and summarizes these frequencies according to pixel-pixel contrast, correlation, variance, or entropy. Each of 13 categories of statistics is measured multiple times by changing the distance and relative orientation of the pixel-pairs.

    Each disk visualizes the results of a search for a particular texture in the original image. The texture search is done in three steps. The first step records fine-grained changes in the grey-tones of the image, the second step records medium-grained changes, and the third step records coarse-grained changes. The three steps are visualized together by using red (step 1), green (step 2), and blue (step 3) colour channels to create a full-colour image representing the whole process. A blue region of the disk would then indicate a region of the original image where the texture is most apparent in coarse-grained grey-tone changes.


    I noticed that the right most disk is occasionally replaced by a new disk and all the other disks move to the left and the last one falls off. What is going on?
    The Grid agent will only display the results of the last 10 image analysis steps. As the next step is completed, its result is displayed, and the oldest is removed.

    In basso a sinistra scorrono informazioni come il nick, il team (mi sembra), i punti fatti, il nome della wu.

    Da guardare giusto per curiosità, e amen

  21. #21
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    no beh certo, però è sempre un surplus, se hanno una grafica carina..

  22. #22
    Shogun Assoluto L'avatar di showa
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    C'è modo di sapere la suddivisione dei crediti fra i vari progetti del WCG (del nostro team)?

  23. #23
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    lo si può sapere a livello globale, ma non al dettaglio, dei vari team o utenti.

    cmq sto elaborando solo WCG sul quad, e sinceramente l'assegnazione dei crediti credo sia la più tirchia fra tutti i progetti..le varie WUs non danno mai oltre i 70-80 crediti..per 3-4 ore di elaborazione..

  24. #24
    Gabi.2437
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    Spinhenge lo batte forse

    10 crediti per 45min di elaborazione su un E6600

    Quindi in 4 ore sono...12,5*4=50 crediti.....

  25. #25
    La Borga L'avatar di dtpancio
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    Predefinito Re: [World Community Grid] Topic ufficiale

    dopo un po' di QMC mi sono abituato decisamente male..

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