World Community Grid
Da questa pagina, ovviamente, si può accedere a tutte le parti del sito. Sezione relativa alle ricerche attualmente portate avanti: http://www.worldcommunitygrid.org/pr...iewResearch.do
Ambito: Ricerca medica
Premessa/Introduzione:
World Community Grid non è un progetto come gli altri, ma presenta alcune differenze. Innanzitutto per lungo tempo ha sfruttato un suo client, chiamato UD (United Devices), e solo recentemente ha supportato BOINC. Il primo che ho citato, sebbene ancora funzionante, si consiglia di non utilizzarlo, perché verrà presto completamente abbandonato.
Altra particolarità è questa: il WCG al suo "interno" porta avanti diversi progetti. Attualmente sono:
- Help Conquer Cancer (lanciato il 6 novembre 2007)
L'Ontario Cancer Institute (OCI), il Princess Margaret Hospital e la University Health Network si sono uniti a World Community Grid per migliorare i risultati della cristallografia a raggi X delle proteine col fine di ampliare le conoscenze sul cancro e sui suoi trattamenti. Link
- Help Fight Childhood Cancer (lanciato il 17 marzo 2009)
L'Università di Chiba, in Giappone, ha lanciato questo progetto che mira a trovare farmaci atti a bloccare 3 proteine che sono la causa del neuroblastoma (un tipo di cancro che colpisce principalmente i bambini). Identificare queste medicine potrebbe rendere il tumore più facilmente curabile dalla chemioterapia. Link
- AfricanClimate@Home (lanciato il 3 settembre 2007)
Il World Community Grid e ricercatori del Climate Systems Analysis Group dell'Università di Città del Capo si sono uniti per sviluppare modelli climatici più accurati degli attuali per specifiche regioni africane. Questo servirà come base per capire come il clima cambierà nel futuro. Link
- Discovering Dengue Drugs - Together (lanciato il 21 agosto 2007)
Scienziati del dipartimento medico dell'Università del Texas e dell'Università di Chicago combattono coi ricercatori del WCG contro alcune delle malattie più diffuse nei paesi sottoviluppati (e non). Il fine immediato del progetto è scoprire nuovi farmaci per curare la febbre emoraggica dengue, l'epatite C, l'encefalite West Nile e la febbre gialla; tutte queste malattie derivano dall'infezione di virus della famiglia Flaviviridae. Link
- Help Cure Muscular Dystrophy (lanciato il 19 dicembre 2006)
Il World Community Grid e i ricercatori supportati da Decrypthon, un'alleanza fra AFM (Associazione Francese Distrofia Muscolare), CNRS (Centro Nazionale Francese per le Ricerche Scientifiche) e IBM stanno indagando sulle interazioni proteine-proteine per 40.000 proteine di cui è nota la struttura, con particolare attenzione su quelle proteine che giocano un ruolo nelle malattie neuromuscolari. Il database che si sta formando aiuterà i ricercatori a produrre molecole per inibire o incrementare i legami di particolari macromolecole, il che si spera porterà a migliori trattamenti per la distrofia muscolare e altre malattie neuromuscolari. Link
- Human Proteome Folding - Phase 2 (lanciato il 23 giugno 2006)
Il progetto continua da dove è terminata la Fase 1. I due obiettivi principali sono: 1) ottenere strutture a risoluzioni più alte di specifiche proteine umane e 2) esplorare ulteriormente i limiti della previsione della struttura delle proteine attraverso l'ulteriore sviluppo del software Rosetta. Link
- FightAIDS@Home (lanciato il 21 novembre 2005)
Come dice il nome, è un progetto che mira a trovare possibili farmaci che abbiano le giuste caratteristiche chimiche per bloccare la proteasi dell'HIV. Questo approccio è chiamato "Structure-Based Drug Design", e secondo il National Institute of General Medical Sciences, ha già avuto un grande impatto sulle vite delle persone che soffrono di AIDS. Link
Il fatto che WCG porti avanti più di una ricerca influenza anche il modo attraverso il quale partecipare con BOINC. La descrizione di come aderire ad uno o più progetti è spiegata immediatamente sotto.
Per aderire al progetto tramite BOINC:
Prima di tutto occorre registrarsi nel sito del WCG, all'indirizzo http://www.worldcommunitygrid.org/reg/viewRegister.do Durante questa fase viene chiesto a quali progetti aderire. Ed è in base alle scelte che si operano che BOINC scaricherà le WU di quel o di quei progetti.
Una volta registrati, la procedura sotto BOINC è uguale a Rosetta, per fare un esempio: il WCG compare nell'elenco, e vi chiederà i dati che avete appena immesso nella pagina del sito.
TGM Team:
Fondato da Kaaio. Come tutti gli altri, si chiama TGM Team. Il link è http://www.worldcommunitygrid.org/te...mId=SK25HC49Q1
Statistiche del TGM Team:
http://it.boincstats.com/stats/team_...r=wcg&id=10226
Stato del progetto e delle iscrizioni:
Il progetto è attivo. Le iscrizioni sono aperte.
Presenza di un forum:
Sì. L'url è http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/index
Disponibilità delle WU:
Eccellente.
Caratteristiche delle WU:
Il tempo di elaborazione delle WU dipende dalla potenza del pc. Si va dalle 3 alle 10 ore.
Presenza dei checkpoint: sì
La distribuzione delle WU del o dei progetti a cui si è aderito viene fatta in automatico dal sistema.
Il tempo di completamento (medio) è di 10 giorni.
Per Human Proteome Folding - Phase 2:
Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 15
Initial replication (numero di WU inviate): 19
Per Fight AIDS@Home:
Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 1
Initial replication (numero di WU inviate): 1
RAM impegnata per ogni WU: circa da 90 a 110 megabyte
Per Help Conquer Cancer:
Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 2
Initial replication (numero di WU inviate): 2
RAM impegnata per ogni WU: circa da 45 a 50 megabyte
Per Help Fight Childhood Cancer:
Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 1
Initial replication (numero di WU inviate): 1
RAM impegnata per ogni WU: circa da 70 a 80 megabyte
Requisiti minimi a livello hardware/software usando BOINC:
Dato che al suo "interno" il World Comunity Grid porta avanti ricerche su diversi temi, i requisiti differiscono da un progetto all'altro. L'elemento in comune è il sistema operativo: Windows 98, ME, 2000 o XP.
AfricanClimate@Home:
- almeno 512 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
- 1 GB di spazio libero sul disco fisso
- possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
- connessione internet con velocità minima 512 kbps
Discovering Dengue Drugs:
- almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
- 50 MB di spazio libero sul disco fisso
- possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
- connessione internet con velocità minima 40 kbps
FightAIDS@Home:
idem come sopra
Human Proteome Folding - Phase 2:
- almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
- 100 MB di spazio libero sul disco fisso
- possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
- connessione internet con velocità minima 40 kbps
Requisiti minimi a livello hardware/software usando il client UD:
FightAIDS@Home:
- processore Intel Pentium a 550MHz o equivalente
- almeno 256 MB di RAM (con memoria virtuale abilitata)
- 50 MB di spazio libero sul disco fisso
- possibilità di far girare grafica a 8-bit alla risoluzione di 800x600
- connessione internet con velocità minima 40 kbps
- Windows 98, ME, 2000 o XP
Human Proteome Folding - Phase 2 project:
Idem come sopra, con la differenza che lo spazio minimo su disco aumenta a 100 MB
Screensaver:
Presente.