Questo è il topic ufficiale. Per non generare dispersioni di topic, si prega di usarlo per postare domande, osservazione e quant'altro relativo al progetto.
Ambito: Ricerca medica
Sito ufficiale: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
Da questa pagina, ovviamente, si può accedere a tutte le parti del sito. Sezione relativa allo scopo del progetto (molto dettagliata, ma parallelamente anche molto tecnica):
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_research.php
Introduzione tradotta/adattata dal sito ufficiale:
Le proteine sono le "macchine" molecolari e i "mattoni" della vita. Le loro funzioni e interazioni sono critiche per i processi vitali di tutti gli organismi. La funzione di una proteina e come interagisce con le altre molecole è in larga parte determinata dalla sua forma (la struttura tridimensionale). Le proteine sono inizialmente sintetizzate come una lunga catena di amminoacidi e, per la maggior parte, non possono funzionare correttamente fino a che non si dispiegano in una intricata struttura globulare. Capire e prevedere le regole che governano questo complesso processo di dispiegamento è uno dei problemi centrali della biologia. Facendo funzionare Rosetta@Home sul vostro computer, ci aiuterete a velocizzare ed estendere le nostre ricerche in una maniera che sarebbe impossibile senza il vostro aiuto. In questo modo ci aiuterete negli sforzi di progettare nuove proteine per combattere malattie come l'HIV, la malaria, il cancro e l'Alzheimer (per ulteriori informazioni, consultate "Disease Related Research":
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_medical_relevance.php).
A tutt'oggi, milioni di dollari sono spesi negli sforzi per determinare sperimentalmente le strutture delle proteine: tramite la cristallografia a raggi-x e la risonanza magnetica nucleare. Se fosse possibile farlo in maniera "virtuale", si ridurrebbero significativamente i costi e si rivoluzionerebbe la biologia strutturale.
Per aderire al progetto tramite BOINC:
Il progetto compare nell'elenco che presenta BOINC
TGM Team:
Fondato da BaRtUc. Come tutti gli altri, si chiama TGM Team. Il link è
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/te...hp?teamid=6155
Statistiche del TGM Team:
http://boincstats.com/stats/team_gra...osetta&id=6155
Stato del progetto e delle iscrizioni:
Il progetto è attivo. Le iscrizioni sono aperte.
Presenza di un forum:
Sì. L'url è
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_index.php
Disponibilità delle WU:
Se si esclude un catastrofico problema all'hardware dei server a inizio settembre, la disponibilità è di norma eccellente.
Caratteristiche delle WU:
Le WU sono molto diverse tra loro e hanno dimensioni variabili a seconda del tipo di proteina studiata.
Molto interessante è la possibilità di scegliere la durata di elaborazione. Si va da un minimo di 3 ore (impostato di default) ad un massimo di 24. Non è che WU più lunghe diano più crediti della altre, quindi settare durate più grandi è esclusivamente una scelta personale. Per variare la durata, dalla pagina del proprio account, cliccare sul "View or edit" di Rosetta@home preferences, poi "Edit Rosetta@home preferences", e infine cambiare il parametro di "Target CPU run time".
Il tempo di completamento è di 10 giorni.
Minimum quorum (numero di WU necessarie dotate di risultato affinché sia valida l'elaborazione): 1
Initial replication (numero di WU inviate): 1
Crediti:
I crediti assegnati per le WU variano in base alla quantità di modelli elaborati. Più un pc è veloce, più modelli elaborerà nel tempo impostato per ogni WU e più crediti riceverà alla fine.
Requisiti minimi a livello hardware/software:
- sistema operativo: da Windows 2000 in poi
- Mac OS X 10.3.9 o superiore
- Red Hat Linux 8.X, 9.X; Mandrake Linux 10.x; Debian Linux 3.0
- RAM: 256MB
- spazio libero su HDD: 200MB
- CPU: 500 Mhz superiore
- Versione Boinc consigliata: l'ultima, a prescindere (nota mia)
Screensaver:
Lo screensaver mostra in tempo reale i dati della proteina, lo stato dell'avanzamento dell'elaborazione e tutte le varie informazioni tecniche (molto oscure ai comuni mortali, in verità).